Научная деятельность ВлГУ ведется по 48 ведущим научным направлениям. Сформировано 20 научных школ.
Создано: межрегиональный многопрофильный и междисциплинарный центр коллективного пользования (перспективных и конкурентоспособных технологий по направлениям развития и применения в промышленности/машиностроении отечественных достижений в области нанотехнологий), центр коллективного природопользования лаборатория "Физико-химических методов анализа", учебно-научные центры (новых инженерных технологий, "Владимирский край"), региональный центр рационального природопользования и экологии человека, региональный центр-филиал Агентства МЧС России по мониторингу и прогнозированию чрезвычайных ситуаций и Центра стратегических исследований гражданской защиты МЧС России, центр компетенции, обучения и проектирования микроэлектромеханических систем, Региональный центр новых информационных технологий.
Действуют научно-образовательные центры (НОЦ):
- внедрения лазерных технологий
- археологических исследований ВлГУ
- автоматизации конструкторско-технологической подготовки производства машиностроительных изделий
- интеллектуальных мехатронных систем и компонентов управления подвижными объектами
- по 2D и 3D наноструктурированным покрытиям
-виртуального инжиниринга и управления сложными техническими объектами
- исследования и диагностирования автотранспортных средств.
- интегрированный НОЦ "Чистая вода" и центр коллективного природопользования
- инновационный НОЦ профессиональной инженерно-технологической подготовки студентов
- проектирования микроэлектромеханических систем
- межфакультетский НОЦ "CALS в электронике".
